Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms