Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Otud6bQ8K2H2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Otud6bQ8K2H2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms