Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
1700001C19RikQ8K168 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms