Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-Q4Q8HWB2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-Q4Q8HWB2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-Q4Q8HWB2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-Q4Q8HWB2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Q4Q8HWB2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Q4Q8HWB2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Q4Q8HWB2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Q4Q8HWB2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Q4Q8HWB2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Q4Q8HWB2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Q4Q8HWB2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Q4Q8HWB2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Q4Q8HWB2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Q4Q8HWB2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Q4Q8HWB2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
H2-Q4Q8HWB2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-Q4Q8HWB2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-Q4Q8HWB2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-Q4Q8HWB2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-Q4Q8HWB2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-Q4Q8HWB2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-Q4Q8HWB2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-Q4Q8HWB2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-Q4Q8HWB2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-Q4Q8HWB2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-Q4Q8HWB2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-Q4Q8HWB2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Q4Q8HWB2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Q4Q8HWB2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Q4Q8HWB2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Q4Q8HWB2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Q4Q8HWB2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Q4Q8HWB2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Q4Q8HWB2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Q4Q8HWB2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Q4Q8HWB2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Q4Q8HWB2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms