Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atg4aQ8C9S8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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