Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa5Q8C7G5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa5Q8C7G5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa5Q8C7G5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa5Q8C7G5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Apoa5Q8C7G5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa5Q8C7G5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa5Q8C7G5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa5Q8C7G5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa5Q8C7G5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa5Q8C7G5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa5Q8C7G5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa5Q8C7G5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa5Q8C7G5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa5Q8C7G5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa5Q8C7G5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa5Q8C7G5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa5Q8C7G5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Apoa5Q8C7G5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoa5Q8C7G5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Apoa5Q8C7G5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Apoa5Q8C7G5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms