Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apol7cQ8C6E1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apol7cQ8C6E1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms