Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cwc22Q8C5N3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cwc22Q8C5N3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cwc22Q8C5N3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cwc22Q8C5N3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cwc22Q8C5N3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cwc22Q8C5N3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cwc22Q8C5N3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cwc22Q8C5N3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cwc22Q8C5N3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms