Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R9

Lrrd1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrd1Q8C0R9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrd1Q8C0R9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms