Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hirip3Q8BLH7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hirip3Q8BLH7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hirip3Q8BLH7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms