Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Smpd4Q6ZPR5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Smpd4Q6ZPR5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms