Protein–RNA interactions for Protein: Q6V4S5

Sdk2, Protein sidekick-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdk2Q6V4S5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdk2Q6V4S5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sdk2Q6V4S5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms