Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fhod1Q6P9Q4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fhod1Q6P9Q4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fhod1Q6P9Q4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fhod1Q6P9Q4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fhod1Q6P9Q4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fhod1Q6P9Q4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fhod1Q6P9Q4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fhod1Q6P9Q4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fhod1Q6P9Q4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fhod1Q6P9Q4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fhod1Q6P9Q4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fhod1Q6P9Q4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fhod1Q6P9Q4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fhod1Q6P9Q4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fhod1Q6P9Q4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fhod1Q6P9Q4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms