Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D5

Sez6l, Seizure 6-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sez6lQ6P1D5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sez6lQ6P1D5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sez6lQ6P1D5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1712 ms