Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptpdc1Q6NZK8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptpdc1Q6NZK8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptpdc1Q6NZK8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms