Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc3bQ6NWW9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fndc3bQ6NWW9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc3bQ6NWW9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms