Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf6Q6NVF9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms