Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg16l2Q6KAU8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg16l2Q6KAU8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms