Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVL5

Lcn12, Epididymal-specific lipocalin-12, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn12Q6JVL5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lcn12Q6JVL5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lcn12Q6JVL5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms