Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Capn11Q6J756 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn11Q6J756 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms