Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5416Q6IE28 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5416Q6IE28 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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