Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Smarca2Q6DIC0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Smarca2Q6DIC0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Smarca2Q6DIC0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms