Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nop58Q6DFW4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Nop58Q6DFW4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms