Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VclQ64727 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VclQ64727 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VclQ64727 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VclQ64727 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VclQ64727 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VclQ64727 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VclQ64727 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VclQ64727 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VclQ64727 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VclQ64727 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VclQ64727 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VclQ64727 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VclQ64727 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VclQ64727 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VclQ64727 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VclQ64727 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VclQ64727 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VclQ64727 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VclQ64727 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VclQ64727 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VclQ64727 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VclQ64727 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VclQ64727 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VclQ64727 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VclQ64727 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VclQ64727 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VclQ64727 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VclQ64727 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VclQ64727 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VclQ64727 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VclQ64727 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VclQ64727 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VclQ64727 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VclQ64727 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VclQ64727 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VclQ64727 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VclQ64727 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VclQ64727 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VclQ64727 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VclQ64727 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VclQ64727 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VclQ64727 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VclQ64727 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VclQ64727 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VclQ64727 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VclQ64727 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VclQ64727 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VclQ64727 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VclQ64727 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VclQ64727 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VclQ64727 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VclQ64727 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VclQ64727 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VclQ64727 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VclQ64727 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VclQ64727 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VclQ64727 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VclQ64727 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VclQ64727 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VclQ64727 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VclQ64727 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VclQ64727 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VclQ64727 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VclQ64727 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VclQ64727 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VclQ64727 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VclQ64727 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VclQ64727 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VclQ64727 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VclQ64727 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VclQ64727 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VclQ64727 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VclQ64727 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VclQ64727 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VclQ64727 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VclQ64727 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VclQ64727 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VclQ64727 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VclQ64727 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VclQ64727 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VclQ64727 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VclQ64727 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VclQ64727 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VclQ64727 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VclQ64727 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VclQ64727 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VclQ64727 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VclQ64727 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VclQ64727 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VclQ64727 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VclQ64727 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VclQ64727 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VclQ64727 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VclQ64727 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VclQ64727 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VclQ64727 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VclQ64727 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VclQ64727 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VclQ64727 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms