Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ccdc18Q640L5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccdc18Q640L5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccdc18Q640L5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
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