Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nptx1Q62443 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nptx1Q62443 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms