Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gli3Q61602 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gli3Q61602 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gli3Q61602 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gli3Q61602 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Gli3Q61602 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gli3Q61602 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gli3Q61602 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Gli3Q61602 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms