Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nell2Q61220 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nell2Q61220 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms