Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn2cQ60772 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdkn2cQ60772 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms