Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc42Q5SV66 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc42Q5SV66 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms