Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc85aQ5SP85 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc85aQ5SP85 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms