Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gm11487Q5RIS0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm11487Q5RIS0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms