Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnni3kQ5GIG6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tnni3kQ5GIG6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tnni3kQ5GIG6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms