Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ecm2Q5FW85 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ecm2Q5FW85 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ecm2Q5FW85 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms