Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA2

Cdv3, Protein CDV3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdv3Q4VAA2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdv3Q4VAA2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdv3Q4VAA2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms