Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
E330034G19RikQ3UWX6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
E330034G19RikQ3UWX6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms