Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrc1Q3UPH1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrc1Q3UPH1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms