Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3UJP5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3UJP5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q3UJP5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q3UJP5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3UJP5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UJP5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UJP5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3UJP5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3UJP5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UJP5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UJP5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Q3UJP5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3UJP5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3UJP5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3UJP5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3UJP5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3UJP5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3UJP5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3UJP5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3UJP5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3UJP5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3UJP5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3UJP5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3UJP5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3UJP5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms