Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp19Q3UJD6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp19Q3UJD6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp19Q3UJD6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms