Protein–RNA interactions for Protein: Q3UE31

Uncharacterized protein KIAA0930 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UE31 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3UE31 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3UE31 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3UE31 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3UE31 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Q3UE31 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q3UE31 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q3UE31 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q3UE31 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q3UE31 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Q3UE31 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3UE31 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3UE31 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3UE31 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3UE31 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3UE31 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3UE31 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q3UE31 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Q3UE31 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q3UE31 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q3UE31 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q3UE31 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q3UE31 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q3UE31 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q3UE31 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3UE31 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3UE31 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3UE31 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3UE31 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3UE31 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3UE31 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3UE31 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3UE31 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3UE31 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3UE31 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3UE31 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q3UE31 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3UE31 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3UE31 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3UE31 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3UE31 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3UE31 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3UE31 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3UE31 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3UE31 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3UE31 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3UE31 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3UE31 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q3UE31 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3UE31 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3UE31 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3UE31 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3UE31 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3UE31 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3UE31 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3UE31 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3UE31 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3UE31 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3UE31 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q3UE31 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3UE31 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3UE31 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3UE31 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3UE31 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3UE31 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3UE31 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q3UE31 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Q3UE31 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3UE31 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3UE31 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3UE31 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3UE31 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3UE31 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3UE31 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3UE31 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3UE31 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3UE31 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3UE31 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3UE31 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3UE31 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3UE31 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3UE31 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3UE31 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3UE31 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3UE31 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q3UE31 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3UE31 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3UE31 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3UE31 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3UE31 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3UE31 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3UE31 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3UE31 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3UE31 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3UE31 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3UE31 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3UE31 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3UE31 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3UE31 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q3UE31 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms