Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Yipf3Q3UDR8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Yipf3Q3UDR8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms