Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp8Q3UD82 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp8Q3UD82 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms