Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trip13Q3UA06 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trip13Q3UA06 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms