Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ccdc136Q3TVA9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ccdc136Q3TVA9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc136Q3TVA9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms