Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUH1

Tamm41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tamm41Q3TUH1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tamm41Q3TUH1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tamm41Q3TUH1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms