Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3TTJ4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Q3TTJ4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TTJ4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms