Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Calr4Q3TQS0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Calr4Q3TQS0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Calr4Q3TQS0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms