Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RubcnlQ3TD16 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RubcnlQ3TD16 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RubcnlQ3TD16 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms