Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prr27Q3SYJ2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms