Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KncnQ307W7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms